В результате была создана первая полная классификация хроматома – совокупности всех белков, взаимодействующих с ДНК в ядре клетки. Исследователи выделили 40 функциональных категорий белков и составили их подробный референсный список. Особое внимание уделялось анализу структуры белков: с помощью машинного обучения были обнаружены ранее неописанные домены, а также выявлено, что многие регуляторные белки содержат гибкие, неупорядоченные участки. Такие фрагменты способны взаимодействовать с разными молекулами и формировать внутри клетки временные структуры – биомолекулярные конденсаты, играющие ключевую роль в регуляции генов.
Все полученные данные и систематизированная информация о белках хроматина доступны на интерактивном веб-ресурсе SimChrom. Эта платформа позволяет изучать локализацию белков в ядре, их доменную организацию и функции.
«Мы объединили разнородные данные и выявили общие принципы организации хроматома человека. Это закладывает фундамент для построения системных моделей функционирования генома и поиска новых молекулярных мишеней для терапии заболеваний», – отмечают авторы исследования.
Понимание работы белков хроматина важно не только для фундаментальной биологии, но и для медицины: нарушения в их функционировании связаны с развитием онкологических и других заболеваний. Результаты работы опубликованы в престижном международном журнале Nucleic Acids Research.
