Математика помогла разгадать тайну нарушения сна

Причин для возникновения различных нарушений сна масса, однако сами процессы которые приводят к такому результату долгое время оставались тайной.

Математики KAIST и их сотрудники из Университета штата Флорида определили принцип того, как старение и такие заболевания, как деменция и ожирение, вызывают нарушения сна. Комбинация математического моделирования и экспериментов продемонстрировала, что скопление цитоплазмы, вызванное старением, деменцией и/или ожирением, нарушает циркадные ритмы в организме человека и приводит к нерегулярным циклам сна и бодрствования. Это открытие предлагает новые стратегии лечения нестабильных циклов сна и бодрствования.

Человеческие тела регулируют режим сна в соответствии с "циркадными ритмами", которые регулируются нашей системой отсчета времени, "циркадными часами". Эти часы говорят нашему телу, когда нужно отдыхать, генерируя 24-часовые ритмы белка, называемого ПЕРИОДОМ (PER).

Математика помогла разгадать тайну нарушения сна

Источник: KAIST

Содержание PER колеблется циркадным образом благодаря авторегуляторной петле отрицательной обратной связи. Это колебание обеспечивает надежное хронометрирование физиологических и поведенческих процессов в циркадном ритме, включая сон.

Количество белка PER увеличивается в течение половины дня, а затем уменьшается в течение оставшейся половины. Принцип состоит в том, что белок PER, накапливающийся в цитоплазме в течение нескольких часов, сразу попадает в ядро ​​клетки, препятствуя транскрипции генов PER и тем самым уменьшая количество PER.

Однако остается загадкой, как тысячи молекул PER могут одновременно входить в ядро ​​в сложной клеточной среде, где сосуществуют различные материалы и могут мешать движению PER. Это все равно что найти способ для тысяч сотрудников со всего Нью-Йорка заходить в офисное здание в одно и то же время каждый день.

Математика помогла разгадать тайну нарушения сна

Источник: KAIST

Пространственная стохастическая модель циркадных часов. После того как мРНК Per, M, транслируется в белок R в цитоплазме (i), PER проходит к перинуклеусу, преодолевая препятствия, будучи гипофосфорилированным (ii; серый кружок). Накопленный в перинукле PER гиперфосфорилируется кооперативным образом (iii). Затем он проникает в ядро ​​и подавляет транскрипционную активность активатора A (iv).

Группа исследователей во главе с профессором Дже Кён Ким из отдела математических наук KAIST разрешила загадку, разработав пространственно-временную и вероятностную модель, которая описывает движение молекул PER в клеточной среде.

Это исследование было проведено в сотрудничестве с группой профессора Чугона Ли из Университета штата Флорида, где проводились эксперименты, и результаты были опубликованы в Proceedings of the National Academy of Sciences (PNAS) в прошлом месяце.

Пространственная стохастическая модель совместной исследовательской группы (изображение выше) описала движение молекул PER в клетках и продемонстрировала, что молекула PER должна быть достаточно конденсированной вокруг ядра клетки, чтобы одновременно фосфорилироваться и вместе войти в ядро ​. Благодаря этому переключателю синхронизации фосфорилирования тысячи молекул PER могут входить в ядро ​​в одно и то же время каждый день и поддерживать стабильные циркадные ритмы.

Математика помогла разгадать тайну нарушения сна

Источник: KAIST

В нормальной клетке (слева) поток цитоплазмы в течение нескольких часов увеличивает содержание PER в перинукле (розовая область на рисунке 2) по сравнению с периферической цитоплазмой (голубая область на рисунке 2) (i). Это вызывает резкое переключающееся гиперфосфорилирование в перинукле за счет кооперативности (ii), за которым следует синхронный вход в ядро ​​в пределах узкого временного окна (iii). Когда клетка переполнена (справа), поток цитоплазмы затруднен, и, таким образом, PER не накапливается в том же градиенте, что и в нормальной клетке (i). Это отключает резкое переключение гиперфосфорилирования PER и проникновение в ядро ​​(ii и iii).

Однако, когда старение и / или заболевания, включая слабоумие и ожирение, вызывают скопление цитоплазмы повышенными цитоплазматическими препятствиями, такими как агрегаты белка и жировые вакуоли, это препятствует своевременной конденсации молекул PER вокруг ядра клетки. В результате переключатель синхронизации фосфорилирования не работает, и белки PER попадают в ядро ​​в нерегулярное время, что делает циркадные ритмы и циклы сна-бодрствования нестабильными.

Автор исследования добавляет:

Как математик, я рад помочь в разработке новых стратегий лечения, которые могут улучшить жизнь многих пациентов, страдающих от нерегулярных циклов сна и бодрствования. Воспользовавшись этими открытиями как возможностью, я надеюсь увидеть более активный обмен идеями и сотрудничество между математическими и биологическими науками.

Читайте также

Ученых шокировала змея, охотящаяся с помощью фальшивого паука на хвосте

Ученых шокировала змея, охотящаяся с помощью фальшивого паука на хвосте

Стартап Hylenr Technologies заявил об обнаружении 32 элементов после эксперимента с ядерным синтезом

Стартап Hylenr Technologies заявил об обнаружении 32 элементов после эксперимента с ядерным синтезом

ООН предупредила: глобальное потепление вскоре превысит критический порог в 1,5 °C

ООН предупредила: глобальное потепление вскоре превысит критический порог в 1,5 °C

Фотон от мощнейшего космического взрыва мог указать на нарушение законов Эйнштейна

Фотон от мощнейшего космического взрыва мог указать на нарушение законов Эйнштейна

Глубоководная рыба умеет ходить по дну задом наперед

Глубоководная рыба умеет ходить по дну задом наперед

Археологи раскрыли истинные причины каннибализма в неолитической Европе

Археологи раскрыли истинные причины каннибализма в неолитической Европе

Ученые выяснили, почему воспоминания не исчезают даже при потере связей в мозге

Ученые выяснили, почему воспоминания не исчезают даже при потере связей в мозге

ИИ OpenAI заявил о решении одной из семи задач тысячелетия

ИИ OpenAI заявил о решении одной из семи задач тысячелетия

15 технологий древности, которыми человечество пользуется до сих пор

15 технологий древности, которыми человечество пользуется до сих пор

Состоялся запуск новейшего космического телескопа NASA

Состоялся запуск новейшего космического телескопа NASA

Семь самых больших машин в истории: гиганты весом в тысячи тонн и длиной в километры

Семь самых больших машин в истории: гиганты весом в тысячи тонн и длиной в километры

Те самые редкоземельные металлы: что в них редкого и зачем они вообще нужны

Те самые редкоземельные металлы: что в них редкого и зачем они вообще нужны

В США создали квантовый датчик, потребляющий всего 5 милливатт

В США создали квантовый датчик, потребляющий всего 5 милливатт

Солнце могло поглотить суперземлю в несколько раз массивнее Земли

Солнце могло поглотить суперземлю в несколько раз массивнее Земли

Открыт новый вид льда, способный объяснить тайны Нептуна и Урана

Открыт новый вид льда, способный объяснить тайны Нептуна и Урана

Ученые предложили печатать дома на Марсе из песка и дрожжей

Ученые предложили печатать дома на Марсе из песка и дрожжей