Математика помогла разгадать тайну нарушения сна

Причин для возникновения различных нарушений сна масса, однако сами процессы которые приводят к такому результату долгое время оставались тайной.

Математики KAIST и их сотрудники из Университета штата Флорида определили принцип того, как старение и такие заболевания, как деменция и ожирение, вызывают нарушения сна. Комбинация математического моделирования и экспериментов продемонстрировала, что скопление цитоплазмы, вызванное старением, деменцией и/или ожирением, нарушает циркадные ритмы в организме человека и приводит к нерегулярным циклам сна и бодрствования. Это открытие предлагает новые стратегии лечения нестабильных циклов сна и бодрствования.

Человеческие тела регулируют режим сна в соответствии с "циркадными ритмами", которые регулируются нашей системой отсчета времени, "циркадными часами". Эти часы говорят нашему телу, когда нужно отдыхать, генерируя 24-часовые ритмы белка, называемого ПЕРИОДОМ (PER).

Математика помогла разгадать тайну нарушения сна

Источник: KAIST

Содержание PER колеблется циркадным образом благодаря авторегуляторной петле отрицательной обратной связи. Это колебание обеспечивает надежное хронометрирование физиологических и поведенческих процессов в циркадном ритме, включая сон.

Количество белка PER увеличивается в течение половины дня, а затем уменьшается в течение оставшейся половины. Принцип состоит в том, что белок PER, накапливающийся в цитоплазме в течение нескольких часов, сразу попадает в ядро ​​клетки, препятствуя транскрипции генов PER и тем самым уменьшая количество PER.

Однако остается загадкой, как тысячи молекул PER могут одновременно входить в ядро ​​в сложной клеточной среде, где сосуществуют различные материалы и могут мешать движению PER. Это все равно что найти способ для тысяч сотрудников со всего Нью-Йорка заходить в офисное здание в одно и то же время каждый день.

Математика помогла разгадать тайну нарушения сна

Источник: KAIST

Пространственная стохастическая модель циркадных часов. После того как мРНК Per, M, транслируется в белок R в цитоплазме (i), PER проходит к перинуклеусу, преодолевая препятствия, будучи гипофосфорилированным (ii; серый кружок). Накопленный в перинукле PER гиперфосфорилируется кооперативным образом (iii). Затем он проникает в ядро ​​и подавляет транскрипционную активность активатора A (iv).

Группа исследователей во главе с профессором Дже Кён Ким из отдела математических наук KAIST разрешила загадку, разработав пространственно-временную и вероятностную модель, которая описывает движение молекул PER в клеточной среде.

Это исследование было проведено в сотрудничестве с группой профессора Чугона Ли из Университета штата Флорида, где проводились эксперименты, и результаты были опубликованы в Proceedings of the National Academy of Sciences (PNAS) в прошлом месяце.

Пространственная стохастическая модель совместной исследовательской группы (изображение выше) описала движение молекул PER в клетках и продемонстрировала, что молекула PER должна быть достаточно конденсированной вокруг ядра клетки, чтобы одновременно фосфорилироваться и вместе войти в ядро ​. Благодаря этому переключателю синхронизации фосфорилирования тысячи молекул PER могут входить в ядро ​​в одно и то же время каждый день и поддерживать стабильные циркадные ритмы.

Математика помогла разгадать тайну нарушения сна

Источник: KAIST

В нормальной клетке (слева) поток цитоплазмы в течение нескольких часов увеличивает содержание PER в перинукле (розовая область на рисунке 2) по сравнению с периферической цитоплазмой (голубая область на рисунке 2) (i). Это вызывает резкое переключающееся гиперфосфорилирование в перинукле за счет кооперативности (ii), за которым следует синхронный вход в ядро ​​в пределах узкого временного окна (iii). Когда клетка переполнена (справа), поток цитоплазмы затруднен, и, таким образом, PER не накапливается в том же градиенте, что и в нормальной клетке (i). Это отключает резкое переключение гиперфосфорилирования PER и проникновение в ядро ​​(ii и iii).

Однако, когда старение и / или заболевания, включая слабоумие и ожирение, вызывают скопление цитоплазмы повышенными цитоплазматическими препятствиями, такими как агрегаты белка и жировые вакуоли, это препятствует своевременной конденсации молекул PER вокруг ядра клетки. В результате переключатель синхронизации фосфорилирования не работает, и белки PER попадают в ядро ​​в нерегулярное время, что делает циркадные ритмы и циклы сна-бодрствования нестабильными.

Автор исследования добавляет:

Как математик, я рад помочь в разработке новых стратегий лечения, которые могут улучшить жизнь многих пациентов, страдающих от нерегулярных циклов сна и бодрствования. Воспользовавшись этими открытиями как возможностью, я надеюсь увидеть более активный обмен идеями и сотрудничество между математическими и биологическими науками.

Читайте также

Ученые раскрыли тайну задержки британского поезда из-за солнечной бури 178 лет спустя

Ученые раскрыли тайну задержки британского поезда из-за солнечной бури 178 лет спустя

Под крупнейшей пустыней Китая обнаружили два крупных источника подземных вод

Под крупнейшей пустыней Китая обнаружили два крупных источника подземных вод

Ученые оцифровали поведение жидкости внутри 3D-печатных конструкций

Ученые оцифровали поведение жидкости внутри 3D-печатных конструкций

Найден опасный порог плотности кости для операций на позвоночнике

Найден опасный порог плотности кости для операций на позвоночнике

Ученые выяснили, что Средиземное море быстро теплеет и становится солонее на глубине до 4 км

Ученые выяснили, что Средиземное море быстро теплеет и становится солонее на глубине до 4 км

Коктейли из антител могут направлять вирусы в эволюционные тупики

Коктейли из антител могут направлять вирусы в эволюционные тупики

Две области мозга борются друг с другом перед рискованным решением

Две области мозга борются друг с другом перед рискованным решением

«Квантум Парк» начал продажи квантовых компьютеров для научных центров

«Квантум Парк» начал продажи квантовых компьютеров для научных центров

Состоялся запуск новейшего космического телескопа NASA

Состоялся запуск новейшего космического телескопа NASA

20 лет назад Плутон перестал быть планетой — почему с этим до сих пор не все согласны?

20 лет назад Плутон перестал быть планетой — почему с этим до сих пор не все согласны?

Пять медицинских роботов, которые уже меняют работу больниц прямо сейчас

Пять медицинских роботов, которые уже меняют работу больниц прямо сейчас

Британский визионер хочет запустить максимально дешевую миссию к Альфа Центавра

Британский визионер хочет запустить максимально дешевую миссию к Альфа Центавра

Mercedes-AMG может представить свой первый электрический заряженный внедорожник 17 октября

Mercedes-AMG может представить свой первый электрический заряженный внедорожник 17 октября

Исследователи с помощью Claude взломали OpenAI и добрались до внутреннего GitHub

Исследователи с помощью Claude взломали OpenAI и добрались до внутреннего GitHub

Астрономы наблюдают «возрожденную» звезду, меняющуюся прямо на глазах

Астрономы наблюдают «возрожденную» звезду, меняющуюся прямо на глазах

Китай показал проект нового термоядерного реактора HL-4 с магнитным полем 25 Тесла

Китай показал проект нового термоядерного реактора HL-4 с магнитным полем 25 Тесла